More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2042 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  77.18 
 
 
249 aa  390  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  56.85 
 
 
257 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  57.5 
 
 
251 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  56.38 
 
 
249 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  56.43 
 
 
254 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  57.92 
 
 
251 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  56.49 
 
 
255 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  57.08 
 
 
251 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  54.55 
 
 
255 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  54.73 
 
 
249 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.93 
 
 
254 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  53.09 
 
 
250 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  59.56 
 
 
258 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  55.1 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  54.66 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  59.11 
 
 
253 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  55.69 
 
 
251 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  59.11 
 
 
253 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  57.78 
 
 
258 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  59.11 
 
 
258 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  59.38 
 
 
247 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  54.62 
 
 
246 aa  261  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  59.38 
 
 
247 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  55.04 
 
 
246 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  58.22 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  58.22 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  58.22 
 
 
258 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  54.03 
 
 
268 aa  258  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  58.67 
 
 
255 aa  258  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  53.78 
 
 
246 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 
262 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.28 
 
 
255 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 
262 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 
262 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 
262 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.28 
 
 
262 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 
255 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  55.28 
 
 
255 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  57.33 
 
 
260 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
269 aa  255  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  56.89 
 
 
257 aa  254  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  58.41 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
260 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  56.44 
 
 
252 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  52.87 
 
 
265 aa  248  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  51.63 
 
 
252 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  53.41 
 
 
269 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  50.21 
 
 
248 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  49.59 
 
 
247 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  46.99 
 
 
629 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  51.27 
 
 
629 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  49.34 
 
 
234 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 
328 aa  208  8e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  45.86 
 
 
631 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
620 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1405  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.52 
 
 
309 aa  205  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 
368 aa  205  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  48.68 
 
 
287 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0559  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 
340 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.98385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
311 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
311 aa  205  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  48.03 
 
 
288 aa  205  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
311 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50 
 
 
327 aa  204  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 
311 aa  204  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  48.48 
 
 
575 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 
339 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 
311 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  42.92 
 
 
311 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 
311 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1811  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50 
 
 
324 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.1 
 
 
571 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 
478 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.37 
 
 
531 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  47.41 
 
 
602 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  54.23 
 
 
238 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  54.23 
 
 
238 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.05 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0128  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.19 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 
905 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 
736 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.44 
 
 
340 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2215  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
376 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.687809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 
347 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1565  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
335 aa  199  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000744963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  53.73 
 
 
238 aa  198  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
559 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 
465 aa  198  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4281  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 
316 aa  198  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113055  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.81 
 
 
686 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.15 
 
 
327 aa  198  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  45.81 
 
 
572 aa  198  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 
313 aa  198  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>