More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1883 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  72.58 
 
 		 254 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  69.96 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  67.46 
 
 		 268 aa  349  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  66.14 
 
 		 257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  68.53 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  68.53 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  61.23 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  56.18 
 
 		 262 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  61.47 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  56.73 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  56.1 
 
 		 247 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  60.79 
 
 		 249 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  58.9 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  57.63 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  58.59 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  52.85 
 
 		 256 aa  271  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.1 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  54.44 
 
 		 251 aa  271  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  59.73 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  57.21 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  56.07 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  56.12 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  55.28 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  53.73 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  55.28 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  58.41 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  55.28 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  57.96 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  59.29 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  53.15 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  55.69 
 
 		 260 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  57.78 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  55.28 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  53.33 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  54.69 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  53.63 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  53.12 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  54.51 
 
 		 247 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  53.69 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  52.23 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  53.75 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  46.59 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  50.64 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 		 347 aa  211  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 		 362 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  54.98 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.63 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  52.23 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1297  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 321 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 		 547 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 320 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 		 571 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2853  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 322 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.242382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1220  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.585278  normal  0.0173539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  46.19 
 
 		 575 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 		 355 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2853  putative ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  46.84 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 		 334 aa  204  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 339 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  45.23 
 
 		 328 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  44.78 
 
 		 572 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  48.48 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2949  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.39 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0919487 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.83 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  48.7 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000886627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  48.07 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 		 336 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  44.35 
 
 		 544 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  48.31 
 
 		 586 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 571 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  44.35 
 
 		 544 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0756  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.288444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  45.53 
 
 		 571 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  42.02 
 
 		 538 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 343 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.752821  normal  0.689608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  44.54 
 
 		 555 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  47.19 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  48.05 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>