More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1306 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  99.62 
 
 
262 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  99.62 
 
 
262 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  99.24 
 
 
262 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  99.24 
 
 
262 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  99.22 
 
 
255 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  99.22 
 
 
255 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  93.33 
 
 
255 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  84.68 
 
 
258 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  84.68 
 
 
258 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  84.68 
 
 
258 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  83.06 
 
 
253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  83.47 
 
 
253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  83.06 
 
 
258 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  82.66 
 
 
258 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  80.97 
 
 
252 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  76.21 
 
 
260 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  73.79 
 
 
260 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  70.16 
 
 
255 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  57.59 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  59.84 
 
 
249 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  61.04 
 
 
251 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  61.04 
 
 
251 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  61.74 
 
 
250 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  58.26 
 
 
256 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  61.45 
 
 
251 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  58.27 
 
 
262 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  58.47 
 
 
255 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  56.47 
 
 
265 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  61.47 
 
 
249 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  57.83 
 
 
251 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  60.67 
 
 
246 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  62.93 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 
254 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  60.25 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  56.05 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  54.44 
 
 
268 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
260 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  54.51 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  55.02 
 
 
269 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  55.28 
 
 
249 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  53.66 
 
 
258 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  52.82 
 
 
257 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  57.85 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  56.63 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  54.62 
 
 
247 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  54.22 
 
 
269 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 
327 aa  225  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  53.25 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  53.88 
 
 
252 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  48.97 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  49.38 
 
 
247 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  47.88 
 
 
539 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  47.67 
 
 
620 aa  212  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4446  ABC transporter related  43.13 
 
 
647 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
292 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  45.31 
 
 
571 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  48.3 
 
 
540 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  48.3 
 
 
540 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  47.92 
 
 
540 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  47.1 
 
 
537 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  49.78 
 
 
572 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  47.55 
 
 
540 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  44.14 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.6 
 
 
339 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.33 
 
 
366 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 
571 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 
539 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
311 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 
311 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  47.15 
 
 
543 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.1 
 
 
364 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 
320 aa  206  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.51 
 
 
571 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 
539 aa  205  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  46.06 
 
 
345 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1249  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
320 aa  205  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  48.92 
 
 
238 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0602  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 
327 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  47.29 
 
 
527 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  47.17 
 
 
540 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.1 
 
 
332 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  46.8 
 
 
545 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  46.61 
 
 
543 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  48.92 
 
 
238 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  45.7 
 
 
617 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.06 
 
 
338 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.02 
 
 
596 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 
338 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.43 
 
 
566 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.06 
 
 
338 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 
339 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>