More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4040 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  95.91 
 
 		 269 aa  477  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  85.07 
 
 		 268 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  72.91 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  68.53 
 
 		 255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  68.53 
 
 		 258 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  67.62 
 
 		 254 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  56.22 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  58.06 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  58.44 
 
 		 246 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  57.61 
 
 		 246 aa  278  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  57.83 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  56.79 
 
 		 252 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  56.85 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  56.85 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  56.85 
 
 		 258 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  57.26 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  56.15 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  54.55 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  56.05 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  53.54 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  54.07 
 
 		 251 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  55.74 
 
 		 249 aa  265  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  54.96 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  52 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  52.96 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  53.25 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  54.37 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  54.25 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  55.9 
 
 		 249 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  53.63 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  53.41 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  52.42 
 
 		 247 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  53.56 
 
 		 246 aa  254  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  52.21 
 
 		 260 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  56.83 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  52.61 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  51.39 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  51.03 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  50.21 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  46.94 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  51.23 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  54.34 
 
 		 228 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1220  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 		 349 aa  215  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.585278  normal  0.0173539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 		 559 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  47.9 
 
 		 547 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  52.05 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0845  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.4 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0435926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  46.86 
 
 		 555 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1704  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 336 aa  211  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.918096  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  47.9 
 
 		 544 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  47.9 
 
 		 544 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.07 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0457  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.96 
 
 		 616 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 		 539 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0152  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 		 310 aa  208  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 		 340 aa  208  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.62904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1405  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.46 
 
 		 309 aa  208  6e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0506  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 		 340 aa  208  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 544 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  45.64 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  47.06 
 
 		 544 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  47.86 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 		 338 aa  204  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 549 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  45.34 
 
 		 544 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  46.32 
 
 		 575 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 		 540 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.94 
 
 		 566 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 543 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.84 
 
 		 586 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 		 571 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 535 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  41.83 
 
 		 310 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  42.64 
 
 		 562 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.64 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2403  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 		 425 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  42.02 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>