More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1762 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1762  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2912  ABC transporter-related protein  57.21 
 
 
223 aa  252  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.421482  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1798  ABC transporter related  61.19 
 
 
227 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  54.59 
 
 
228 aa  238  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  49.77 
 
 
238 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  49.77 
 
 
238 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  49.77 
 
 
238 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  54.73 
 
 
246 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  51.72 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  51.98 
 
 
234 aa  198  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  52.71 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  45 
 
 
257 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  51.71 
 
 
253 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  46.61 
 
 
256 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  45.7 
 
 
249 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  52.2 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.17 
 
 
255 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  52.2 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  52.2 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  51.71 
 
 
253 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 
254 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  51.22 
 
 
258 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  48.84 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  50.73 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  49.01 
 
 
255 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  49.51 
 
 
246 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  49.75 
 
 
250 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
255 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
262 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
255 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  51.47 
 
 
262 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  51.22 
 
 
262 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  51.47 
 
 
262 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
262 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  45.13 
 
 
265 aa  184  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  49 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  46.36 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  45.45 
 
 
262 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  47.78 
 
 
260 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  46.8 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  50.25 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  48.99 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  50 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  49.49 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  46.15 
 
 
258 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  46.12 
 
 
247 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  45.91 
 
 
255 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  49.75 
 
 
249 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  47.78 
 
 
249 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  45.32 
 
 
246 aa  175  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  48.99 
 
 
251 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  45.12 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  44.04 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
269 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  43.98 
 
 
247 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  43.52 
 
 
247 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  45.54 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
327 aa  158  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  47.34 
 
 
269 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  38.81 
 
 
575 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.29 
 
 
676 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 
426 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5788  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 
328 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  37.68 
 
 
308 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  40.29 
 
 
565 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.28 
 
 
566 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  48.44 
 
 
252 aa  151  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  42.58 
 
 
540 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  42.58 
 
 
540 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  37.62 
 
 
270 aa  151  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
308 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  42.11 
 
 
540 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  42.11 
 
 
540 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  42.11 
 
 
540 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  41.95 
 
 
308 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  38.54 
 
 
282 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.29 
 
 
599 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
308 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 
289 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  42.58 
 
 
540 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  38.54 
 
 
308 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  37.56 
 
 
308 aa  148  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  42.11 
 
 
261 aa  148  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.16 
 
 
326 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  41.71 
 
 
544 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
308 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  41.98 
 
 
563 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
282 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
540 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  34.22 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  37.44 
 
 
552 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4501  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229817 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
344 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0219399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>