More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1147 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  57.27 
 
 
674 aa  770    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.27 
 
 
690 aa  678    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.78 
 
 
703 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
676 aa  1363    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.85 
 
 
708 aa  713    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  45.62 
 
 
712 aa  591  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.68 
 
 
686 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 
711 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.97 
 
 
749 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.2 
 
 
756 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.68 
 
 
736 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.17 
 
 
680 aa  572  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
659 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  44.61 
 
 
658 aa  547  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7097  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.16 
 
 
718 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.15 
 
 
725 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 
615 aa  542  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
665 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.51 
 
 
695 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.3 
 
 
725 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.09 
 
 
671 aa  534  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.44 
 
 
699 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 
677 aa  526  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
905 aa  528  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 
725 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.04 
 
 
611 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  43.4 
 
 
629 aa  504  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1420  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.84 
 
 
695 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0353718  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  46.48 
 
 
611 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
609 aa  498  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 
611 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 
611 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.48 
 
 
571 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  45.5 
 
 
612 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.14 
 
 
611 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.65 
 
 
599 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  41.18 
 
 
693 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.867925  normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 
625 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  43.12 
 
 
627 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2467  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.97 
 
 
695 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.380053  normal  0.0115313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 
625 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.52 
 
 
617 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
633 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.78 
 
 
640 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2059  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 
694 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  43.29 
 
 
597 aa  485  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  44 
 
 
612 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  41.64 
 
 
610 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  44.85 
 
 
640 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  42.58 
 
 
606 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 
629 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
601 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.79 
 
 
562 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
632 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  44.23 
 
 
619 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  44.01 
 
 
628 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 
637 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.56 
 
 
626 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
627 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
620 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  43.63 
 
 
630 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.9 
 
 
615 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  42.27 
 
 
599 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  42.86 
 
 
609 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.2 
 
 
633 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.99 
 
 
611 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  42.47 
 
 
602 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  43.76 
 
 
624 aa  475  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.07 
 
 
619 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.37 
 
 
633 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.7 
 
 
619 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  44.08 
 
 
611 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 
623 aa  475  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 
629 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.82 
 
 
572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
629 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  44.87 
 
 
566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.67 
 
 
691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2406  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 
744 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.18 
 
 
631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 
623 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1411  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.88 
 
 
701 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.58 
 
 
612 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  42.12 
 
 
603 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  42.26 
 
 
617 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  42.58 
 
 
612 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  42 
 
 
623 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  42.15 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.77 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 
623 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  41.32 
 
 
571 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  42.9 
 
 
623 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.88 
 
 
632 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  43.34 
 
 
611 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>