More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3969 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  99.57 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  99.15 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  91.49 
 
 		 235 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  80.08 
 
 		 236 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  79.24 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  79.24 
 
 		 236 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  80.08 
 
 		 236 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  79.66 
 
 		 236 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  62.03 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  64.65 
 
 		 249 aa  278  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  58.4 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  60 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.19 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  41.77 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  41.55 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  32.72 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  34.13 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  34.43 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  34.1 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  35.21 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  31.25 
 
 		 247 aa  118  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  33.86 
 
 		 365 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.22 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  33.33 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  35.68 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  34.43 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  34.26 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  34.54 
 
 		 337 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  33.02 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 355 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 355 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 355 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 355 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.94 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  36.98 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30.2 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  31.61 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  33.33 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  31.25 
 
 		 360 aa  108  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.87 
 
 		 363 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  29.8 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.2 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  33.8 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  34.65 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  30.5 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  35.71 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  33.03 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  31.22 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  31.07 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27830  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.62 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 274 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  31.22 
 
 		 372 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  33.16 
 
 		 365 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  33.01 
 
 		 552 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  34.38 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  32.68 
 
 		 309 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07870  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.995675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 		 355 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  33.33 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  35.24 
 
 		 355 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  33.33 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  35.24 
 
 		 355 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.5 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  35.24 
 
 		 355 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  35.48 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 		 564 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  35.24 
 
 		 355 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.97 
 
 		 355 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  31.82 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  31.78 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.6 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  29.65 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  31.22 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  35.38 
 
 		 309 aa  104  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  35.38 
 
 		 309 aa  104  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 		 539 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0519  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  30 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  30.66 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  31.08 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  30.37 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  32 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  31.56 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  35.03 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  30.58 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  33.33 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.7 
 
 		 346 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  33.33 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>