More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0080 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  98.73 
 
 
236 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  98.73 
 
 
236 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  98.31 
 
 
236 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  82.63 
 
 
236 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  79.66 
 
 
235 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  79.24 
 
 
235 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  79.66 
 
 
235 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  77.97 
 
 
235 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  62.87 
 
 
238 aa  310  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  62.18 
 
 
239 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  60.5 
 
 
239 aa  292  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  63.13 
 
 
249 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  59.35 
 
 
248 aa  265  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  53.22 
 
 
230 aa  251  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.59 
 
 
239 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 
240 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  40 
 
 
239 aa  187  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 
224 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  39.9 
 
 
221 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  35.58 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  33.33 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  33.64 
 
 
244 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
246 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  34.72 
 
 
229 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  36.36 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  36.22 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  33.62 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  31.88 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.05 
 
 
238 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  36.45 
 
 
232 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  34.4 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  34.13 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  32.46 
 
 
501 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  35.75 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  30.84 
 
 
372 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  31.25 
 
 
360 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  30.84 
 
 
372 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  31.25 
 
 
360 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  31.25 
 
 
360 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  31.62 
 
 
360 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.67 
 
 
387 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  29.08 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0982  cell division ATP-binding protein FtsE  29.08 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.356751  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  30.8 
 
 
363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  30.8 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  30.8 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  31.75 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.22 
 
 
388 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  33.66 
 
 
365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  30.77 
 
 
197 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  34.78 
 
 
593 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  32.21 
 
 
355 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0807  ABC transporter-related protein  29.36 
 
 
236 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.147643  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.33 
 
 
363 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  32.84 
 
 
241 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  31.42 
 
 
237 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  31.96 
 
 
365 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  30.36 
 
 
363 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0717  ABC transporter related  30.69 
 
 
249 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.02 
 
 
363 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  32.39 
 
 
367 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  31.34 
 
 
218 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
388 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  30.42 
 
 
356 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  31.55 
 
 
240 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  32.14 
 
 
247 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
390 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2913  cell division ATP-binding protein FtsE  33.51 
 
 
238 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 
367 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1660  ABC transporter related  32 
 
 
364 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.698685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 
386 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  29.38 
 
 
228 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 
386 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 
333 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  30.34 
 
 
240 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  32.74 
 
 
368 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 
333 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  31.71 
 
 
370 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2638  ABC transporter related protein  36.14 
 
 
248 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.545525  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  31.33 
 
 
243 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 
386 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  31.2 
 
 
231 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  32.74 
 
 
363 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  32.89 
 
 
386 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 
386 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.67 
 
 
260 aa  105  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  33.5 
 
 
309 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  30.17 
 
 
247 aa  105  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  30.65 
 
 
238 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.82 
 
 
226 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  31.63 
 
 
258 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.82 
 
 
226 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
355 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  31.53 
 
 
243 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
355 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
355 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  30.65 
 
 
238 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>