More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2632 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  81.03 
 
 		 232 aa  347  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  79.74 
 
 		 232 aa  341  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  55.84 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2919  ABC transporter-related protein  57.71 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  37.04 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  35.38 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  34.86 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  34.86 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  34.91 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  34.91 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  34.4 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  34.4 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  33.93 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  35.02 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.58 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  38.59 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  39.25 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  39.02 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  32.11 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.91 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0139  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.91 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  39.29 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  40.86 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  35 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.76 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.18 
 
 		 377 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  36 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  36.11 
 
 		 337 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.43 
 
 		 458 aa  105  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.83 
 
 		 279 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 344 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5023  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.37 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  36.92 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  37.56 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  36.36 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  34.7 
 
 		 365 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  40.29 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  35.32 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  35.79 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  42.54 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 		 402 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  35.35 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  37.04 
 
 		 495 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  34.16 
 
 		 387 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  33.73 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.99 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2269  ABC transporter related  35.71 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.53 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 386 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  31.5 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  38.27 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 386 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  32.46 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 386 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 378 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  37.85 
 
 		 383 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.55 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 386 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  31.51 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  38.22 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1387  sulphate transport system permease protein 1  32.3 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  34.31 
 
 		 376 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  35.75 
 
 		 564 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0169  cell division ATP-binding protein FtsE  38.69 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  31.53 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  34.15 
 
 		 384 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 		 388 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.18 
 
 		 387 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 386 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  36.7 
 
 		 365 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 379 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 337 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  36 
 
 		 382 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  36.59 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.11 
 
 		 354 aa  99  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  34.15 
 
 		 384 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  36.56 
 
 		 256 aa  99  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  41.71 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 470 aa  98.6  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.69 
 
 		 501 aa  98.6  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.67 
 
 		 400 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  31.95 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 354 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.43 
 
 		 368 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>