More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2269 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2269  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  49.55 
 
 		 356 aa  228  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0029  ABC transporter related  52.32 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000212578  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  45.3 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  42.98 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 366 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  42.74 
 
 		 366 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  40.17 
 
 		 352 aa  158  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 354 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  38.06 
 
 		 353 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  33.33 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 		 336 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 		 362 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.77 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  41.1 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 343 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  40.42 
 
 		 359 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  39.45 
 
 		 343 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 343 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  37.8 
 
 		 348 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  39.65 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  39.65 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  38.82 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  38.82 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  38.82 
 
 		 343 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  37.13 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.65 
 
 		 362 aa  151  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 357 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  37.1 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  36.55 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 354 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.21 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 		 338 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  40.47 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  38.77 
 
 		 343 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  38.53 
 
 		 351 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  38.43 
 
 		 342 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  40.85 
 
 		 345 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1404  ABC transporter related  36.91 
 
 		 356 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0478366  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 378 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  40.44 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.89 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  37.39 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1227  ABC transporter related  36.48 
 
 		 379 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000640126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  38.53 
 
 		 338 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  37.02 
 
 		 349 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  39.82 
 
 		 360 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  36.86 
 
 		 348 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 		 355 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  38.39 
 
 		 350 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  33.61 
 
 		 356 aa  145  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.82 
 
 		 378 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  35.37 
 
 		 383 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  38.12 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.43 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  38.39 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  34.19 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 378 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  36.09 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  37.84 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  36.09 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.04 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  36.61 
 
 		 365 aa  143  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0346  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.96 
 
 		 345 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  37.09 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  37.33 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 		 354 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.17 
 
 		 372 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  37.39 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 382 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  39.08 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  39.01 
 
 		 377 aa  143  3e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  38.5 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  36.48 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.32 
 
 		 372 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4038  ABC transporter-like  36.13 
 
 		 384 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 		 379 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 		 357 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  37.5 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 		 339 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>