More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4038 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4038  ABC transporter-like  100 
 
 
384 aa  795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  36.77 
 
 
356 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
366 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  29.54 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.74 
 
 
364 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  34.89 
 
 
352 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  32.59 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  37.34 
 
 
364 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2269  ABC transporter related  36.13 
 
 
256 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0029  ABC transporter related  41.5 
 
 
242 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000212578  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.96 
 
 
244 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
343 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  35.59 
 
 
256 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  32.94 
 
 
356 aa  133  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1785  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0353  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  34.98 
 
 
342 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1821  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2083  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0819  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1110  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  35.56 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  34.76 
 
 
322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  32.18 
 
 
348 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  32.18 
 
 
348 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5373  ABC transporter related  40.47 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5487  ABC transporter related  40.47 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523314  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  32.64 
 
 
367 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.98 
 
 
352 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1250  methionine import ATP-binding protein MetN  35.11 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  33.89 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2376  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23096  normal  0.11127 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.39 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  34.91 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  34.73 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  36.67 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0447  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  36.64 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.13 
 
 
240 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  36.04 
 
 
342 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  35.27 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  36.36 
 
 
328 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  33.18 
 
 
376 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0358  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
319 aa  126  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.703642  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  34.2 
 
 
361 aa  125  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.16 
 
 
365 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  36.05 
 
 
359 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.03 
 
 
360 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  38.71 
 
 
347 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  30.77 
 
 
258 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  37.33 
 
 
243 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  36.21 
 
 
354 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  35.53 
 
 
350 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.87 
 
 
370 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  31.41 
 
 
360 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  33.73 
 
 
348 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  34.23 
 
 
383 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  34.08 
 
 
341 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  29.81 
 
 
364 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
353 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  32.39 
 
 
384 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  33.88 
 
 
334 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  31.27 
 
 
384 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.4 
 
 
352 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  30.91 
 
 
369 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4784  ABC transporter related  39.25 
 
 
347 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  28.1 
 
 
355 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  27.79 
 
 
355 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 
379 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
357 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  30.09 
 
 
379 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
353 aa  123  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.6 
 
 
399 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 
372 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
347 aa  123  5e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
364 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  36.03 
 
 
363 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  32.06 
 
 
360 aa  123  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  34.78 
 
 
372 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  30.61 
 
 
362 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  32.51 
 
 
355 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  36.65 
 
 
386 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  26.24 
 
 
386 aa  123  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
370 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  31.68 
 
 
356 aa  123  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  34.56 
 
 
397 aa  123  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  31.15 
 
 
359 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.47 
 
 
364 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  34.09 
 
 
353 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  31.94 
 
 
345 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  30.61 
 
 
244 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  35 
 
 
328 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0811  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
371 aa  122  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  31.8 
 
 
333 aa  122  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  35.6 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.49 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1388  ABC transporter related  33.51 
 
 
253 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>