More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0892 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  100 
 
 
364 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  58.38 
 
 
365 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  50.14 
 
 
366 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
366 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  41.81 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  36.14 
 
 
347 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.67 
 
 
364 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2269  ABC transporter related  45.3 
 
 
256 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  35.31 
 
 
355 aa  203  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  34.49 
 
 
348 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  34.32 
 
 
360 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
367 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.7 
 
 
371 aa  192  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.63 
 
 
362 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  35.19 
 
 
355 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 
349 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 
365 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  31.06 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  33.33 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 
338 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 
368 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.8 
 
 
354 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 
357 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 
370 aa  189  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  33.43 
 
 
351 aa  189  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.03 
 
 
352 aa  189  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  31.32 
 
 
363 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.63 
 
 
363 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  37.72 
 
 
347 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.63 
 
 
363 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.26 
 
 
352 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  34.34 
 
 
356 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  41.9 
 
 
353 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
347 aa  186  4e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1111  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
384 aa  186  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.32 
 
 
363 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  43.7 
 
 
352 aa  186  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 
355 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  36.04 
 
 
361 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 
356 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  38.7 
 
 
353 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.42 
 
 
386 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  34.41 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  34.57 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  42.15 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  33.84 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  35.74 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.83 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  32.43 
 
 
386 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.96 
 
 
372 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  38.13 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  37.63 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  36.36 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  38.24 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.27 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.79 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1496  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.38 
 
 
384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  36.01 
 
 
353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 
333 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.89 
 
 
343 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 
359 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  37.66 
 
 
353 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.75 
 
 
378 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.83 
 
 
356 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
352 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.24 
 
 
354 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  42.74 
 
 
348 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
355 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.39 
 
 
364 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
355 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
355 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
355 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
352 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.53 
 
 
387 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  38.01 
 
 
353 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  33.15 
 
 
386 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  34.66 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.9 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  36.34 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.43 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0823  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.73 
 
 
376 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
366 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  32.77 
 
 
362 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  33.83 
 
 
365 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  35.36 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.36 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.36 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 
366 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
355 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
355 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  41.92 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  34.98 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.33 
 
 
386 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.42 
 
 
381 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  44.49 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.33 
 
 
386 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>