More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0029 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0029  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000212578  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2269  ABC transporter related  52.32 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  53.02 
 
 		 356 aa  218  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  44.59 
 
 		 365 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  43.1 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 366 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  45.29 
 
 		 364 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1388  ABC transporter related  40.83 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4038  ABC transporter-like  41.5 
 
 		 384 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  41 
 
 		 365 aa  154  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  36.82 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  34.43 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  36.48 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  38.12 
 
 		 376 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  39.71 
 
 		 334 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 355 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.19 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  38.07 
 
 		 335 aa  145  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  38.42 
 
 		 365 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 		 362 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 364 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  39.32 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  38.24 
 
 		 341 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 354 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  37.56 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 355 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  47.4 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.19 
 
 		 357 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  38.61 
 
 		 342 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 270 aa  141  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  39.41 
 
 		 362 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  41.09 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  35.82 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6173  ABC transporter related  41.95 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.204705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  38.74 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 		 395 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  36.41 
 
 		 345 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  41.5 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  39.71 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.54 
 
 		 399 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 		 393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  42.35 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  36.32 
 
 		 374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  39.42 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  36.61 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.3 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.44 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  37.44 
 
 		 360 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.64 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.98 
 
 		 355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.92 
 
 		 359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  38.24 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 340 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  36.41 
 
 		 357 aa  138  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  38.07 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.14 
 
 		 393 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  41.58 
 
 		 305 aa  138  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  37.81 
 
 		 338 aa  138  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  33.49 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  38.97 
 
 		 353 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2030  ABC transporter related  37.21 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107118 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4748  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.09 
 
 		 354 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.8 
 
 		 364 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  38.25 
 
 		 353 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  37.84 
 
 		 355 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  37.39 
 
 		 355 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  40.09 
 
 		 364 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  38.69 
 
 		 382 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  37.39 
 
 		 355 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  38.33 
 
 		 416 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  34.36 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  41.26 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  40.98 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  36.94 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.42 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  39.41 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  37.39 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  37.39 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0032  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 346 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 		 355 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  37.81 
 
 		 364 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3573  ABC transporter related  36.4 
 
 		 348 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.736918  normal  0.213742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>