More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1227 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1227  ABC transporter related  100 
 
 		 379 aa  741    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000640126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1404  ABC transporter related  53.33 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0478366  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  49.66 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.18 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  45.43 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  47.95 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.48 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  48.3 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  48.42 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  45.75 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  49.82 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  38.34 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  51.03 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  46.07 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  43.79 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  48.06 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.04 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.26 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  41.32 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  47.45 
 
 		 342 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  41.33 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  47.95 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.86 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.16 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  40.32 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  37.56 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.3 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 342 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  41.75 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.01 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.37 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  50.58 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.28 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  46.85 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  50.58 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  47.1 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  50.58 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  46.15 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.97 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 		 358 aa  236  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.96 
 
 		 353 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.96 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.21 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  37.93 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  42.2 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  47.15 
 
 		 347 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  44 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  51.04 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  42.66 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  49.59 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.57 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.28 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 353 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  42.72 
 
 		 366 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 		 357 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  44.19 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 		 353 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  38.94 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  38.64 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  39.59 
 
 		 357 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  37.14 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  44.8 
 
 		 376 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  43.91 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.96 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.87 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  42.66 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  48.36 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  38.73 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  45.02 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  47.92 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  50.21 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.52 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.46 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  48.36 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 333 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.32 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>