More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0754 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  100 
 
 		 206 aa  401  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  96.12 
 
 		 206 aa  388  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1140  ABC transporter related  51.21 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  50.49 
 
 		 219 aa  201  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  50.49 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  49.25 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15620  ABC transporter related  47.09 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1096  ABC transporter related  36.82 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0596237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  37.25 
 
 		 237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  38.97 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.86 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  39.8 
 
 		 264 aa  124  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  35.18 
 
 		 253 aa  124  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  37.43 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  35.38 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  35.58 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3346  ABC transporter related  37.57 
 
 		 532 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  36.84 
 
 		 242 aa  121  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 		 301 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 		 276 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0739  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  38.46 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0348008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  36.54 
 
 		 742 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3466  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.71 
 
 		 569 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3473  ABC transporter related  37.02 
 
 		 532 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  34.11 
 
 		 980 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  34.18 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  35.48 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3672  ABC transporter related  37.02 
 
 		 533 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  36.32 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  35.35 
 
 		 384 aa  118  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  36.68 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  31.71 
 
 		 577 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  32.2 
 
 		 577 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  34.36 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  34.36 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.88 
 
 		 579 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 341 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 		 376 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  31.19 
 
 		 305 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  33.63 
 
 		 712 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  33.33 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  36.61 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  35.32 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  35.92 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  35.03 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  36.45 
 
 		 247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  31.22 
 
 		 577 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  35.83 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  35.58 
 
 		 739 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  31.43 
 
 		 718 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  31.46 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  37.5 
 
 		 259 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 408 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  30.93 
 
 		 548 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  34 
 
 		 723 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  31.43 
 
 		 718 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  33.66 
 
 		 738 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  33.33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08631  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.296362  hitchhiker  0.00137214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  32.3 
 
 		 712 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  32.27 
 
 		 720 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  36.07 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  33 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  36.07 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 595 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  31.48 
 
 		 718 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  34.76 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  37.04 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  34.27 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  32.84 
 
 		 562 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 		 247 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.93 
 
 		 507 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0405  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 		 392 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  35 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  32.83 
 
 		 252 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  34.22 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  38.5 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  37.16 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 378 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.5 
 
 		 573 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  31.31 
 
 		 592 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  36.04 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  32.02 
 
 		 613 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>