More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1510 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  82.46 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  69.03 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  64.1 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  64.53 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  61.34 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  62.34 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  58.87 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  45.11 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  43.78 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  46.02 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  45.13 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  45.89 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  45.81 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  40.52 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  35.77 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  39.5 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  37 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  39.66 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  36.12 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  40.61 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0673  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  38.24 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  35.8 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  36.51 
 
 		 246 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  45.37 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  38.14 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  37.55 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2974  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  37.71 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2993  ABC transporter related  37.24 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0697  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0680  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0744  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  42.27 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  38.36 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 264 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  35.68 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0597  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  35.71 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  36.4 
 
 		 246 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  47.35 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  38.82 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  37.99 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.93 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  34.17 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  36.84 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  36.84 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  35.96 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  41.48 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  37.97 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  42.48 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  38.4 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  35.15 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  35.37 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  35.24 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  36.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  36.41 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  37.29 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  36.56 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  34.32 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 364 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  37.55 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.27 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  36.44 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  36.29 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  37.19 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  36.44 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  35.45 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  35.45 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  36.29 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  36.4 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  34.93 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  36.71 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>