More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3624 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  81.97 
 
 		 243 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  66.26 
 
 		 238 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  66.26 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  61.32 
 
 		 238 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  63.71 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  51.9 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  50.42 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  54.11 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  47.86 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  50.86 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.21 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  47.35 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  49.77 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  44.87 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  46.52 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  39.82 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  39.47 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  41.81 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  48.47 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  40.83 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.48 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 365 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  39.57 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.71 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  39.32 
 
 		 253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 352 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.71 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 352 aa  144  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  39.64 
 
 		 397 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  39.06 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  34.44 
 
 		 247 aa  141  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  36.55 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  38.11 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.66 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  40.27 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  36.36 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  37.14 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  39.24 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  33.92 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  36.51 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 341 aa  138  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  38.62 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  37.95 
 
 		 362 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 342 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.79 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  39.82 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  38.02 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  38.02 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  36.28 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  38.84 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  38.02 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  38.02 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  38.02 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  34.84 
 
 		 342 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  38.27 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.9 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  36.99 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 516 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 		 595 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.68 
 
 		 364 aa  135  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  35.29 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  35.46 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  36.55 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  35.46 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  35.29 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  35.53 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  38.03 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  39.46 
 
 		 353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  35.46 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  34.48 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  40.17 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  39.01 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.15 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  35.62 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  34.91 
 
 		 253 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf864  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.94 
 
 		 355 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  35.11 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.75 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  35.04 
 
 		 368 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  35.46 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 510 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  39.21 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  41.63 
 
 		 364 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  39.21 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.29 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  39.21 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  38.57 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>