More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0567 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  71.91 
 
 		 235 aa  355  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  39.65 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  38.39 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  38.39 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  37.39 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  37.5 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  34.06 
 
 		 251 aa  138  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  34.35 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  34.16 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  37.12 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  37.5 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  32.07 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  31.6 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  32.05 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  31.65 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.36 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  32.75 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  36.56 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  32.11 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.51 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  35.92 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  31.72 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  28.69 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  28.63 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  28.63 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  33.16 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  34.4 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  33.63 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  31.17 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  32.86 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  28.94 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.2 
 
 		 364 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 299 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  30.67 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  31.37 
 
 		 301 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.01 
 
 		 299 aa  108  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  31 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  27.2 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  28.29 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  31.82 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.85 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.81 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  32.39 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  29.15 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  29.09 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  29.13 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  28.71 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4184  daunorubicin resistance ABC transporter ATP- binding subunit  34.93 
 
 		 328 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00696491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  31.31 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  27.12 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  27.73 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  26.94 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  28.11 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  26.17 
 
 		 352 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.13 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  26.85 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  27.53 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  25.55 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  27.13 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  25.66 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  32.07 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  29.95 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  25.96 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  26.29 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  29.15 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.44 
 
 		 516 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0719  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.153614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  26.15 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  24.59 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0645  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  26.17 
 
 		 352 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  34.13 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.88 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  27.78 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4165  ABC transporter related  25.39 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  27.83 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  25.12 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1053  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.588648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  28.77 
 
 		 263 aa  101  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  28.29 
 
 		 352 aa  101  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  27.19 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  27.7 
 
 		 308 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  25.21 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  28.44 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  35 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  29.41 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0061  ABC transporter related  29.27 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>