More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1668 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0504  ABC transporter related  63.76 
 
 		 239 aa  314  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930668  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  40 
 
 		 338 aa  161  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.73 
 
 		 308 aa  160  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  38.82 
 
 		 319 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.65 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  35.12 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  36.86 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  35.68 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.24 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.85 
 
 		 304 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.2 
 
 		 312 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 312 aa  154  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  35.87 
 
 		 300 aa  154  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 310 aa  154  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  38.17 
 
 		 310 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  38.17 
 
 		 310 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.17 
 
 		 310 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  37.66 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.33 
 
 		 319 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  38.35 
 
 		 312 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 300 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 300 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 300 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  35.66 
 
 		 257 aa  151  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 300 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  37.66 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 331 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.57 
 
 		 741 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  39.15 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.65 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  33.06 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 299 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 300 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  39.62 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.94 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.82 
 
 		 312 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  39.21 
 
 		 388 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 313 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.53 
 
 		 305 aa  148  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 313 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.27 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.76 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  38.57 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40.09 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 		 338 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  36.13 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.07 
 
 		 301 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 		 342 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  33.77 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  34.72 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  34.91 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  33.62 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  37.5 
 
 		 322 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  35.62 
 
 		 337 aa  144  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 280 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  35.75 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.4 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.94 
 
 		 312 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  34.7 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 		 580 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  37.27 
 
 		 319 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.1 
 
 		 316 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.16 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  34.7 
 
 		 320 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  33.74 
 
 		 580 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  37.09 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  35.02 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  33.2 
 
 		 512 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  33.33 
 
 		 583 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.53 
 
 		 338 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>