More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1728 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  520  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  59.09 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  52.94 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  52.05 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  48.59 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  48.59 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  48.59 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  49.79 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  49.32 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  47.81 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  46.49 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  48.93 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  48.93 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  50.23 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  48.93 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  48.5 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  48.93 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  48.86 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  48.93 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  46.56 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  47.27 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  48.64 
 
 		 269 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  45.37 
 
 		 256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  47.21 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  47.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  44.24 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  46.78 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  44.24 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  46.36 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  46.82 
 
 		 247 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  39.75 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  41.6 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  49.54 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  49.54 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  44.1 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  41.53 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  45.16 
 
 		 249 aa  195  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  49.07 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  41.63 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  42.08 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  41.39 
 
 		 301 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  44.74 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  42.92 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  40.93 
 
 		 316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  44.75 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  33.49 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  37.02 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  37.02 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  38.7 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  36.82 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.99 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  33.64 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  33.64 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  31.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  35.68 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  36.4 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  37.28 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  32.64 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  29.46 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  34.04 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  35.07 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  34.89 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  32.03 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  33.19 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  28.82 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  33.49 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  33.08 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  32.03 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  34.07 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  29.86 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  41.24 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  33.9 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  30.86 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  32.2 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.71 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  32.78 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  34.27 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  37.71 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  34.35 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>