More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0627 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  100 
 
 		 251 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  50.43 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  49.35 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  45.89 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  48.9 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  44.12 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  46.26 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  37.13 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  46.26 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  42.02 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  45.61 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  42.53 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  46.67 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  40.52 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  40 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.78 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.45 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  45.32 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  43.72 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  40.97 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  42.99 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  38.08 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1009  phosphate transporter ATP-binding protein  32.95 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  39.01 
 
 		 354 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  35.02 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  35.12 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  35.27 
 
 		 366 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  35.68 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  34.18 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  49.77 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  33.9 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  39.57 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  39.57 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.59 
 
 		 381 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  39.57 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  33.06 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.64 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1565  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.65 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.133599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.67 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  48.87 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  34.06 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  33.75 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  41.36 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  37 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  38.07 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1826  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.53 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  33.78 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  32.92 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.71 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.05 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  36.73 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  39.33 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  37.19 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  32.31 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0989  phosphate transporter ATP-binding protein  31.01 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  38.27 
 
 		 353 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1074  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  33.19 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1879  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.415603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  34.87 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.93 
 
 		 367 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  34.27 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  39.65 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  37.17 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1387  sulphate transport system permease protein 1  33.19 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  34.2 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  37.28 
 
 		 248 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0719  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.153614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  36.36 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  37.13 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 		 516 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0645  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  37.02 
 
 		 365 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.65 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0448  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.69 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1705  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.113372  hitchhiker  0.00997988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  36.44 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1751  ABC transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.303296 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  35.51 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  44.29 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>