More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1705 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1814  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1705  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.113372  hitchhiker  0.00997988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1751  ABC transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.303296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1522  ABC transporter ATP-binding subunit  98.35 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332613  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1754  ABC transporter ATP-binding subunit  97.53 
 
 		 243 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664491  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1187  ABC transporter related  73.33 
 
 		 241 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  44.29 
 
 		 242 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  43.05 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  42.27 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  42.68 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  42.15 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  42.15 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  42.6 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  42.99 
 
 		 252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  42.2 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  38.81 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  39.92 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  42.73 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  40.77 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  41.18 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  41.77 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  43.18 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  41.74 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  43.12 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  42.52 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  42.99 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  41.7 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  42.99 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  42.99 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  42.99 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  38.75 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  37.97 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  40.66 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  43.38 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  40.18 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  41.7 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  42.79 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  40.25 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  39.42 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  40.87 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  41.74 
 
 		 363 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  41.74 
 
 		 363 aa  190  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1740  ATPase  39.27 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000485262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  42.66 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  42.72 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  41.74 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  39.51 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  42.06 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  42.72 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  39.29 
 
 		 261 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  43.38 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  44.5 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  38.17 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  41.28 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  38.39 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  43.44 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  39.5 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  41.55 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  38.66 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.87 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  40.93 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  38.08 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  39.75 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  39.75 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  40.45 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  39.75 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  42.15 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  43.66 
 
 		 255 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 252 aa  187  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  41.82 
 
 		 247 aa  187  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 252 aa  187  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  42.06 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  41.67 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  44.09 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  39.75 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  42.72 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  39.75 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  39.42 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  43.75 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>