More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1740 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1740  ATPase  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000485262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  66.67 
 
 		 360 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  63.6 
 
 		 363 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  63.6 
 
 		 363 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  66.23 
 
 		 363 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  66.23 
 
 		 363 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.77 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.77 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  60.53 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  54.15 
 
 		 240 aa  267  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  58.77 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  57.46 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  57.46 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.46 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.59 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  57.02 
 
 		 241 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.46 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  57.46 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  57.46 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  53.28 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  57.02 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  53.51 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.71 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.9 
 
 		 240 aa  258  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.02 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.95 
 
 		 242 aa  257  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  52.84 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  52.63 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  53.02 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  51.97 
 
 		 240 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  50.88 
 
 		 242 aa  254  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  50.87 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  50.87 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  51.97 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  51.97 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  52.84 
 
 		 242 aa  252  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  50.87 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  52.4 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  51.97 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.95 
 
 		 244 aa  251  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  51.75 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  51.53 
 
 		 240 aa  251  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  51.32 
 
 		 247 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.09 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.48 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  51.79 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.74 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.25 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.07 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  52.86 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  53.95 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  53.3 
 
 		 247 aa  248  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.53 
 
 		 244 aa  248  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  51.32 
 
 		 246 aa  248  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  51.97 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  51.88 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  51.09 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  50.22 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.71 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  51.27 
 
 		 251 aa  247  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  51.53 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  52.63 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  49.57 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  53.28 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.97 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  48.33 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  52.19 
 
 		 257 aa  245  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.53 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  53.71 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  50 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  51.53 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  49.56 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  48.95 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51.53 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  50.22 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.05 
 
 		 244 aa  242  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>