More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1700 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
272 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  93.75 
 
 
272 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  93.01 
 
 
272 aa  530  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  93.38 
 
 
272 aa  530  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  93.01 
 
 
272 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  93.01 
 
 
272 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  93.01 
 
 
272 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  91.91 
 
 
272 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  91.91 
 
 
272 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  91.91 
 
 
272 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  91.91 
 
 
272 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  92.65 
 
 
272 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  91.91 
 
 
272 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  93.56 
 
 
264 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  91.18 
 
 
272 aa  520  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  91.91 
 
 
272 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  81.47 
 
 
279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  75.37 
 
 
272 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  75.37 
 
 
272 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  78.38 
 
 
273 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  74.54 
 
 
277 aa  424  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  73.9 
 
 
272 aa  421  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  76.77 
 
 
277 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  76.47 
 
 
277 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  76.47 
 
 
277 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  73.7 
 
 
277 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
277 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  76.08 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  72.96 
 
 
277 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
277 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
270 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
262 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
270 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
270 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  74.51 
 
 
285 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  72.05 
 
 
272 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.02 
 
 
276 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  73.49 
 
 
285 aa  401  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  67.16 
 
 
271 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  68.73 
 
 
276 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  74.12 
 
 
277 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  72.18 
 
 
284 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  72.16 
 
 
283 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
271 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
271 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  70.54 
 
 
271 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  65.28 
 
 
268 aa  374  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  66.29 
 
 
261 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  67.61 
 
 
258 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  66.27 
 
 
253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  65.59 
 
 
260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.53 
 
 
251 aa  355  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  63.97 
 
 
262 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.89 
 
 
253 aa  352  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.11 
 
 
292 aa  352  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  65.49 
 
 
257 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  66 
 
 
252 aa  349  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 
262 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.16 
 
 
262 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.57 
 
 
252 aa  349  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 
255 aa  348  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.35 
 
 
255 aa  348  6e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  62.99 
 
 
253 aa  348  7e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.81 
 
 
260 aa  347  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 
260 aa  346  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.16 
 
 
252 aa  345  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.14 
 
 
301 aa  346  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 
253 aa  345  5e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  64.75 
 
 
256 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4349  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  345  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4289  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4171  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4009  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  345  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4019  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  345  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4493  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4402  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.49 
 
 
253 aa  344  8e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 
258 aa  344  8.999999999999999e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.81 
 
 
273 aa  344  8.999999999999999e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4385  phosphate transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
271 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2997  phosphate transporter ATP-binding protein  63.35 
 
 
271 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
251 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.24 
 
 
254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  63.97 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 
251 aa  342  5e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.97 
 
 
249 aa  341  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
253 aa  341  7e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
265 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  63.22 
 
 
252 aa  340  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64 
 
 
252 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4122  phosphate transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 
271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.67 
 
 
260 aa  338  4e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1826  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.45 
 
 
275 aa  339  4e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  62.35 
 
 
249 aa  339  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 
275 aa  338  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>