More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3943 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  81.97 
 
 		 244 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  64.88 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  64.46 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  60.33 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  61.44 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  48.31 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  51.67 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  46.15 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.57 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  50.22 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  49.35 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  48.87 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  45.06 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  40.09 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  47.79 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  46.78 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  45.49 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  44.02 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  38.37 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  36.55 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  39.22 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  36.56 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  36.84 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  37.19 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  38.63 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  32.9 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  36.4 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  37.94 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  34.15 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  41.49 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 355 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30.53 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  35.74 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.24 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  32.64 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  37.3 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.93 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  37.72 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  36.36 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1905  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  36.36 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  31.95 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  35.1 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  33.33 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.43 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0977682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  32.05 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  38.4 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  34.04 
 
 		 244 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1303  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.41 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.673171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  36.36 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  34.45 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  37.87 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1096  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  32.55 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.53322  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1879  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.415603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  34.16 
 
 		 252 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  37.89 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  38.3 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.55 
 
 		 331 aa  131  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.41 
 
 		 310 aa  131  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5023  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 295 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  35.27 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0694  ABC transporter related  36.25 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  34.3 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  36.4 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.2 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.92 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 276 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3266  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3103  phosphate transporter ATP-binding protein  34.41 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  38.94 
 
 		 388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  36.17 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  34.65 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  35.95 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.56 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.06 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  31.02 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  37.19 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.79 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>