More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7227 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  85.38 
 
 		 253 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4165  ABC transporter related  83 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  82.21 
 
 		 253 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  82.21 
 
 		 253 aa  431  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  81.03 
 
 		 253 aa  427  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  73.91 
 
 		 253 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  66.94 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  65.45 
 
 		 255 aa  339  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  61.63 
 
 		 252 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  62.86 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  61.63 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  65.2 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  65.04 
 
 		 255 aa  328  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2525  ABC transporter related  57.85 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  53.06 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.24 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  51.22 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  50.41 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  50.41 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.2 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.26 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.84 
 
 		 247 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.85 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.85 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  49.38 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  48.05 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  49.8 
 
 		 242 aa  248  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 		 249 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  48.98 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50 
 
 		 252 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.61 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  48.4 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  46.48 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  49.39 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  47.41 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  49.17 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1258  putative amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  47.81 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1928  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.495016  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  48.03 
 
 		 278 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5592  ABC transporter related  49.4 
 
 		 266 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.13 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  45.87 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.59 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  48.05 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  48.97 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.59 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  47.01 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.59 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.59 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  48.59 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  47.35 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  47.35 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0779  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  47.41 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.52 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.52 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 		 265 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 		 245 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  47.18 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.39 
 
 		 245 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.59 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  46.94 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  46.77 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  47.77 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  46.53 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  46.15 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.39 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  46.53 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  46.43 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>