More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3837 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4165  ABC transporter related  95.26 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  85.38 
 
 
253 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  81.03 
 
 
253 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.24 
 
 
253 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.24 
 
 
253 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  76.28 
 
 
253 aa  407  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  66.94 
 
 
255 aa  339  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  65.71 
 
 
253 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  64.9 
 
 
252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  64.9 
 
 
252 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  65.31 
 
 
252 aa  332  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  65.31 
 
 
257 aa  327  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2525  ABC transporter related  60.92 
 
 
268 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  65.31 
 
 
255 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  53.88 
 
 
244 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 
244 aa  280  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
244 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
244 aa  279  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
244 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
244 aa  278  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
244 aa  278  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
244 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 
244 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  52.03 
 
 
244 aa  271  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  49.59 
 
 
243 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  49.59 
 
 
243 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
243 aa  258  7e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  50.21 
 
 
251 aa  254  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.65 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.24 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.65 
 
 
252 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.65 
 
 
252 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  49.59 
 
 
253 aa  251  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50 
 
 
242 aa  250  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  52.48 
 
 
252 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
253 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.83 
 
 
247 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  48.05 
 
 
253 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  47.52 
 
 
245 aa  248  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5592  ABC transporter related  50.6 
 
 
266 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.94 
 
 
240 aa  248  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 
249 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0779  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
248 aa  247  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
245 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  51.23 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.38 
 
 
250 aa  244  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  48.44 
 
 
275 aa  244  8e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  49.38 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  48.21 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1258  putative amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  48.57 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  48.39 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.59 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  49.38 
 
 
244 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  48.59 
 
 
254 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  48.39 
 
 
265 aa  242  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.96 
 
 
250 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.96 
 
 
250 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  46.53 
 
 
242 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  46.53 
 
 
242 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  50.81 
 
 
243 aa  242  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.96 
 
 
250 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  47.6 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  50.41 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.96 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  51.02 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  48.57 
 
 
242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.96 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  49.8 
 
 
278 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  49.39 
 
 
256 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  49.79 
 
 
263 aa  242  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
248 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  49.8 
 
 
248 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  51.02 
 
 
240 aa  241  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  48.18 
 
 
271 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  46.22 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  50.2 
 
 
240 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  47.98 
 
 
265 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  48.05 
 
 
253 aa  240  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.39 
 
 
245 aa  240  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  49.39 
 
 
243 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  48.98 
 
 
247 aa  239  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  47.35 
 
 
247 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1928  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.495016  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.52 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.72 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.52 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
241 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  48.57 
 
 
240 aa  238  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  45.71 
 
 
241 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  45.71 
 
 
241 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  47.35 
 
 
247 aa  238  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  48.57 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  46.53 
 
 
241 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  45.71 
 
 
241 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
254 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>