More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3154 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  99.6 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2525  ABC transporter related  93.66 
 
 		 268 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  92.86 
 
 		 252 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  74 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  71.6 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  70 
 
 		 257 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4165  ABC transporter related  65.71 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  64.08 
 
 		 253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  64.9 
 
 		 253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  69.39 
 
 		 253 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.27 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.27 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  61.63 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  65.85 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.84 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.43 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.43 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  50.61 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  48.58 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.11 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.7 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.7 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  52.65 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.7 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.7 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.7 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.15 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.87 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  48.35 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  54.25 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  54.44 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.24 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.24 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.24 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.41 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  47.52 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.84 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.83 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5245  ABC transporter related  56.1 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0596713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  51.43 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  47.37 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  47.37 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  48.37 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  48.35 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.21 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  51.02 
 
 		 248 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 266 aa  241  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  50.61 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  46.96 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.04 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  47.27 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.04 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  46.96 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.04 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.04 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  47.58 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  49.8 
 
 		 252 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  48.78 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  53.69 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  44.9 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.98 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  50.62 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.79 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  50.61 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  53.28 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  46.53 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  44.63 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  48.19 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  51.85 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1258  putative amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  47.08 
 
 		 268 aa  234  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  47.51 
 
 		 274 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  45.71 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  45.93 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  48.98 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  45.71 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  45.31 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>