More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5245 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5245  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0596713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  63.98 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.3 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  56.3 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  58.3 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  55.69 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.9 
 
 		 249 aa  274  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.87 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  55.06 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  55.06 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  55.06 
 
 		 259 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.63 
 
 		 268 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  55.06 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  55.06 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  52.55 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  55.77 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 240 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  56.2 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  54.66 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  53.2 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  53.85 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  52.76 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  51.21 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.18 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  53.97 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  55.12 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  53.1 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  55.79 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  55.79 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  55.12 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  54.98 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  52.23 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  55.37 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  55.12 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  55.37 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  51.41 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  56.63 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  51.41 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  54.25 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 		 244 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  54.96 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 267 aa  264  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.54 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 		 244 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.4 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 		 257 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  52.78 
 
 		 273 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  51.6 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.85 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.84 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  53.44 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  53.85 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  52.38 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5592  ABC transporter related  54.55 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.66 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  52.78 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  52.78 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  51.2 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  52.78 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  261  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  52.63 
 
 		 259 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  51 
 
 		 244 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.44 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  54 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.04 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  52.21 
 
 		 243 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  53.85 
 
 		 265 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  52.38 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  53.85 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  52.63 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  53.44 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  49.8 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  52.02 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.82 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  54.33 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>