More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3103 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3266  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
259 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3103  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
259 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1308  phosphate transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 
276 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.43291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00535  phosphate transporter ATP-binding protein  74.3 
 
 
276 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1285  phosphate transporter ATP-binding protein  71.6 
 
 
284 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1349  phosphate transporter ATP-binding protein  71.6 
 
 
284 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  69.72 
 
 
255 aa  384  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.72 
 
 
255 aa  384  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0783  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
280 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2017  phosphate transporter ATP-binding protein  67.05 
 
 
282 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1621  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0577  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1488  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0885  phosphate transporter ATP-binding protein  68.38 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1192  phosphate transporter ATP-binding protein  67.72 
 
 
282 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270941  normal  0.470836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2770  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2182  phosphate transporter ATP-binding protein  68 
 
 
262 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.508405  normal  0.137715 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1518  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1180  phosphate transporter ATP-binding protein  67.72 
 
 
282 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1294  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0574  phosphate transporter ATP-binding protein  67.32 
 
 
282 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149562  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4446  phosphate transporter ATP-binding protein  67.47 
 
 
282 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  66.54 
 
 
263 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0822  phosphate transporter ATP-binding protein  67.72 
 
 
282 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  66.93 
 
 
263 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1274  phosphate transporter ATP-binding protein  67.72 
 
 
282 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1303  phosphate transporter ATP-binding protein  67.72 
 
 
282 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348683  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  68.55 
 
 
263 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2855  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
282 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2164  phosphate transporter ATP-binding protein  67.2 
 
 
262 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1269  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
282 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237624  normal  0.121063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4063  phosphate transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
269 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4079  phosphate transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
269 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4242  phosphate transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
269 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4135  phosphate transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
269 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4140  phosphate transporter ATP-binding protein  67.34 
 
 
257 aa  364  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.6 
 
 
260 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4185  phosphate transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
269 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.6 
 
 
260 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03609  phosphate transporter subunit  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5154  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.550814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4269  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.31 
 
 
260 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4203  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3940  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03553  hypothetical protein  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
257 aa  363  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  64.09 
 
 
259 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  64.94 
 
 
263 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  63.32 
 
 
260 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7425  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.13 
 
 
270 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.06 
 
 
260 aa  360  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4234  phosphate transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 
258 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4194  phosphate transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 
258 aa  360  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256725  hitchhiker  0.00751177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4168  phosphate transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 
258 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 
258 aa  359  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.82 
 
 
261 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
258 aa  358  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  65.12 
 
 
258 aa  358  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
305 aa  358  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 
259 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6687  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 
270 aa  357  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5183  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.66 
 
 
271 aa  357  9e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4716  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.66 
 
 
271 aa  357  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2341  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.25 
 
 
271 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.113454  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  64.98 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0836  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.17 
 
 
260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00992429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5255  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.06 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.273698  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  64.59 
 
 
257 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0779  phosphate transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
274 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.78 
 
 
278 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.9 
 
 
295 aa  353  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5263  phosphate transporter ATP-binding protein  64.92 
 
 
273 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0200  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
275 aa  351  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1989  phosphate transporter ATP-binding protein  61.96 
 
 
266 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0891  phosphate transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
274 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
264 aa  349  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  62.3 
 
 
272 aa  349  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  62.35 
 
 
260 aa  348  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2949  phosphate transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 
267 aa  348  6e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
303 aa  347  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3411  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 
258 aa  345  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0509  phosphate transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 
273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2686  phosphate transporter ATP-binding protein  62.86 
 
 
265 aa  341  8e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0630967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3272  phosphate transporter ATP-binding protein  62.86 
 
 
265 aa  341  8e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143231  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.26 
 
 
254 aa  340  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1290  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.54 
 
 
261 aa  338  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1335  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.78 
 
 
268 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
277 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
277 aa  334  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
277 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1275  phosphate transport ATP-binding protein  64.82 
 
 
261 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 
272 aa  330  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2830  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.75 
 
 
278 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  59.38 
 
 
285 aa  329  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 
277 aa  328  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  60.31 
 
 
283 aa  327  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>