More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5504 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  79.58 
 
 		 240 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  50.83 
 
 		 259 aa  214  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  47.86 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  45.69 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  47.88 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  47.88 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  46.67 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  47.58 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  50.86 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.92 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  45.37 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  45.37 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  44.64 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  49.35 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  45.64 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  37.34 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  44.8 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  41.1 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.18 
 
 		 364 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  36.17 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  40.83 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  40.42 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.19 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  39.53 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  33.62 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  36.51 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  36.12 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  34.82 
 
 		 352 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  40.69 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.62 
 
 		 355 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  36.97 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  38.86 
 
 		 347 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  34.89 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  33.63 
 
 		 235 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  34.76 
 
 		 360 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  32.91 
 
 		 240 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  35.78 
 
 		 340 aa  131  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  38.39 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  33.92 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1652  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  39.48 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  38.86 
 
 		 416 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  38.59 
 
 		 359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  38.6 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  34.17 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  32.79 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  34.75 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  37.92 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  37.92 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0694  ABC transporter related  35.34 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  40.53 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  35.62 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  37.92 
 
 		 252 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  35.78 
 
 		 362 aa  128  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  38.96 
 
 		 360 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3956  ABC transporter related  36.68 
 
 		 355 aa  128  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.396032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.48 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.48 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  35.44 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  37.78 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  32.91 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  35.08 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0551  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.41658  hitchhiker  1.7806299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 343 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  38.77 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  39.91 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  34.43 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4234  ABC transporter related  40.43 
 
 		 345 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  32.22 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.5 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  33.47 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 267 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  33.73 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  35.78 
 
 		 356 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  37.89 
 
 		 366 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0904  ABC transporter related  32.91 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.04 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  33.86 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  38.17 
 
 		 382 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  35.83 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>