More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0904 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0904  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  264  8e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  55.7 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  49.58 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  54.01 
 
 		 243 aa  244  9e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  50.85 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  50.83 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  49.58 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  51.79 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  50.62 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  49.38 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  51.13 
 
 		 244 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  47.92 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  51.82 
 
 		 243 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  47.19 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  46.61 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  52.68 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  48.75 
 
 		 250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  46.61 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  49.58 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  49.58 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  49.58 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  48.48 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  50.21 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.75 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  49.58 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  48.05 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  48.93 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  50.68 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  48.05 
 
 		 243 aa  232  5e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.74 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  48.12 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  50.42 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  49.15 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.86 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  53.46 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  50.91 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  48.66 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  45.68 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  46.61 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  46.06 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  49.38 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  48.07 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  45.68 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  45.34 
 
 		 240 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  48.52 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  50.42 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  53 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  48.32 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  46.06 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  50.45 
 
 		 247 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  44.84 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  45.8 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  50.45 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  46.47 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  48.74 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  52.32 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  47.88 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  50.64 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  47.28 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0877  polar amino acid ABC transporter ATPase  47.3 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00896077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  52.29 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  43.51 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  47.28 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  46.84 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 244 aa  226  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  47.88 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  49.57 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  47.46 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  48.73 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  45.38 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  45.68 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  48.93 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  49.55 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  48.21 
 
 		 243 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  47.88 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  47.88 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  47.03 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  45.34 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 		 240 aa  224  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  47.62 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  46.41 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>