More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1821 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  84.71 
 
 
249 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  84.3 
 
 
242 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2069  ABC transporter related  85.12 
 
 
244 aa  393  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.870513  normal  0.162781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
244 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.39 
 
 
240 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.5 
 
 
244 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.66 
 
 
242 aa  257  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  54.36 
 
 
246 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.11 
 
 
242 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.32 
 
 
252 aa  254  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.21 
 
 
259 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  51.87 
 
 
244 aa  252  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.87 
 
 
244 aa  251  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.24 
 
 
242 aa  250  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
240 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  52.24 
 
 
251 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  48.95 
 
 
240 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  51.05 
 
 
240 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  53.39 
 
 
242 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 
245 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  50.62 
 
 
242 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  53.31 
 
 
245 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  53.2 
 
 
258 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  249  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
282 aa  248  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  52.52 
 
 
257 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.87 
 
 
254 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  50.62 
 
 
242 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.72 
 
 
246 aa  246  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  51.46 
 
 
249 aa  246  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 
258 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  50.63 
 
 
260 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  52.1 
 
 
245 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  50.63 
 
 
260 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  51.46 
 
 
240 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
244 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.81 
 
 
263 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.63 
 
 
260 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  52.52 
 
 
247 aa  245  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.1 
 
 
239 aa  245  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  50.63 
 
 
255 aa  245  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.46 
 
 
242 aa  245  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
273 aa  245  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  51.05 
 
 
243 aa  245  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2453  ABC transporter related  51.22 
 
 
250 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0640162  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  50.21 
 
 
248 aa  245  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.3 
 
 
244 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  49.37 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  52.5 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.28 
 
 
257 aa  244  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.52 
 
 
249 aa  244  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0118  ABC transporter related  51.63 
 
 
250 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  50.21 
 
 
248 aa  244  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.14 
 
 
244 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0904  ABC transporter related  54.01 
 
 
249 aa  244  9e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  49.37 
 
 
249 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  50.84 
 
 
240 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  51.25 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  48.95 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  51.88 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  50.21 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  50.21 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  50.21 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
241 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  242  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  242  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  50.63 
 
 
243 aa  242  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  52.67 
 
 
265 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  242  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  51.44 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  51.85 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  50.63 
 
 
243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.82 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  50.84 
 
 
241 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  241  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  52.1 
 
 
245 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 
284 aa  241  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  53.56 
 
 
254 aa  241  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
244 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 
251 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
244 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
269 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  49.38 
 
 
242 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  50.84 
 
 
244 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
244 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
252 aa  240  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
254 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
244 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  50.2 
 
 
259 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>