More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2702 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  73.28 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  47.91 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  38.3 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  42.19 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  40.28 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  45.62 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  43.16 
 
 		 337 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  41.95 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  42.45 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  44.28 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  45.18 
 
 		 356 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  37.07 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  41 
 
 		 365 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  44 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  42.24 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.05 
 
 		 364 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  36.12 
 
 		 365 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.75 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.38 
 
 		 363 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.28 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.44 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  36 
 
 		 366 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.35 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.35 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  41.75 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.35 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.54 
 
 		 387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.8 
 
 		 361 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  38.57 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  39.8 
 
 		 426 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  42.41 
 
 		 343 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  34.56 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 		 349 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  37.84 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  39.71 
 
 		 353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 		 400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  33.64 
 
 		 370 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2269  ABC transporter related  38.73 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  40 
 
 		 349 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  38.02 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.26 
 
 		 386 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 		 386 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 		 386 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  37.12 
 
 		 364 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.78 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 		 356 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  38.69 
 
 		 372 aa  125  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  37.89 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 		 388 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1222  ABC transporter related  40 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.31 
 
 		 363 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  37.89 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  37.89 
 
 		 236 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.69 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1776  ABC transporter related  43.75 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.680063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 		 377 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 		 388 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.25 
 
 		 371 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.7 
 
 		 386 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.7 
 
 		 386 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  38.89 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.7 
 
 		 386 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 367 aa  123  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 		 368 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  40.1 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.7 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.97 
 
 		 372 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  37.7 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2769  cell division ATP-binding protein FtsE  37.9 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 346 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.3 
 
 		 384 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 384 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.05 
 
 		 377 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 		 403 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 377 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  40.72 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.67 
 
 		 366 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 356 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.37 
 
 		 357 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  36.74 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 		 343 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 		 388 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 356 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 		 353 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.3 
 
 		 384 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  37.67 
 
 		 356 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.3 
 
 		 384 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 		 353 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>