More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4319 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  98.73 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  99.15 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  98.73 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  82.2 
 
 		 236 aa  401  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  79.66 
 
 		 235 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  79.24 
 
 		 235 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  79.66 
 
 		 235 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  77.54 
 
 		 235 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  62.45 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  61.76 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  60.5 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  63.13 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  59.35 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  53.22 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1132  ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.17 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003506  ABC-type tungstate transport system ATP-binding protein  39.58 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1399  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2082  ABC transporter related  40.51 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  35.41 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  33.91 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  32.86 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  35.23 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  33.19 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  36.87 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  36.22 
 
 		 337 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  31.88 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2867  ABC transporter related  36.92 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2632  ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0326334  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.05 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2461  ABC transporter related  36.65 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405076  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  34.13 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  31.94 
 
 		 501 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  31.7 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  31.7 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  31.7 
 
 		 360 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  30.84 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.11 
 
 		 387 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  30.84 
 
 		 372 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  31.62 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  31.42 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1660  ABC transporter related  32.5 
 
 		 364 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.698685  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  31.25 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  31.25 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  28.43 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  33.66 
 
 		 365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0982  cell division ATP-binding protein FtsE  28.43 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.356751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.67 
 
 		 388 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 365 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  30.8 
 
 		 363 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  30.77 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  32.14 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0807  ABC transporter-related protein  28.9 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.147643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  30.85 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  32.21 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  33.78 
 
 		 388 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  30.42 
 
 		 356 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  33.5 
 
 		 309 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  31.75 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0717  ABC transporter related  30.69 
 
 		 249 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  34.78 
 
 		 593 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.33 
 
 		 363 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  30.36 
 
 		 363 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.78 
 
 		 390 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  31.2 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30.15 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.4 
 
 		 363 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 386 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.67 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  30.65 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2638  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.545525  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  32.84 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  34.01 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  30.17 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  31.55 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  30.65 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 386 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 386 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 386 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2913  cell division ATP-binding protein FtsE  33.51 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 355 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  30.84 
 
 		 367 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1444  ATPase  29.47 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 355 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  29.63 
 
 		 654 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  30.57 
 
 		 393 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  29.38 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 355 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  31.33 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  31.7 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 355 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  31.7 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  30.95 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>