More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0643 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0966  ABC transporter related  54.55 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0048  ABC transporter related  55.67 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3685  ABC transporter-related protein  33.68 
 
 		 238 aa  111  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4721  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.07 
 
 		 619 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  30.77 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  30.77 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  31 
 
 		 235 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  30.77 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  30.77 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  31 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  33.33 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  30.5 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0992  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 		 311 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 594 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3881  ABC transporter related  30.52 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 		 594 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 		 597 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.88 
 
 		 595 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2651  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  33.82 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  36.1 
 
 		 597 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.1 
 
 		 597 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4096  ABC transporter related  29.15 
 
 		 248 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 		 592 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  35 
 
 		 272 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  33.82 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 		 316 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1099  ABC transporter related  35.75 
 
 		 274 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  hitchhiker  0.000176016 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  34.88 
 
 		 745 aa  102  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0085  ABC transporter related  29.65 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  33.17 
 
 		 257 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  34.62 
 
 		 337 aa  101  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0122  ABC transporter-related protein  30 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1970  ABC transporter related  36.19 
 
 		 288 aa  100  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00267126  hitchhiker  0.00000000346858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 299 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0225  ABC transporter related  37.62 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  37.38 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  37.38 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  33.98 
 
 		 337 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.3 
 
 		 350 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  35.07 
 
 		 665 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  38.66 
 
 		 328 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 		 595 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.85 
 
 		 810 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  32 
 
 		 574 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3568  ABC transporter related  35.89 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  36.73 
 
 		 270 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 261 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 362 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1418  ABC transporter related  28.86 
 
 		 283 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  36.73 
 
 		 270 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  34.38 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  34.65 
 
 		 319 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  29.59 
 
 		 235 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  31.98 
 
 		 253 aa  99  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5577  ABC transporter-related protein  37.56 
 
 		 255 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  32.87 
 
 		 236 aa  99  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  32.86 
 
 		 276 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  38.69 
 
 		 270 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.17 
 
 		 359 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  36.07 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  37.04 
 
 		 264 aa  98.6  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  35.2 
 
 		 308 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  36.73 
 
 		 270 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0431  ABC transporter related  34.3 
 
 		 278 aa  98.6  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.739427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  35.62 
 
 		 586 aa  98.6  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.05 
 
 		 251 aa  98.2  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  33.51 
 
 		 241 aa  98.2  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  30.81 
 
 		 310 aa  98.2  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  36.32 
 
 		 252 aa  98.2  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.98 
 
 		 338 aa  97.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  36.92 
 
 		 331 aa  97.8  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  34.59 
 
 		 321 aa  97.8  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  34.85 
 
 		 310 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0792  ABC transporter related  36.13 
 
 		 325 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  33.5 
 
 		 253 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.84 
 
 		 322 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  34.9 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.06 
 
 		 312 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  35.02 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  34.9 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  34.85 
 
 		 310 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  34.56 
 
 		 312 aa  97.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1322  ABC transporter related  36.63 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  34.85 
 
 		 310 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2030  ABC transporter related  34.92 
 
 		 264 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  35.71 
 
 		 270 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  32.35 
 
 		 272 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3919  ABC transporter related  30.53 
 
 		 249 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0617327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  34.31 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  37.07 
 
 		 266 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  28.97 
 
 		 308 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>