More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2651 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2651  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3794  ABC transporter related  54.73 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0167031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  48.33 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  48.93 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  48.12 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  46.06 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  47.88 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  46.89 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  48.54 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  46.44 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  46.72 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  44.77 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  44.77 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  46.03 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  45.64 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  45.64 
 
 		 255 aa  224  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  48.1 
 
 		 243 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  46.4 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  45.64 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  46.06 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.91 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  46.86 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  46.47 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  43.57 
 
 		 249 aa  221  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  43.57 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  47.28 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  44.81 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  45.19 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  43.15 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  47.21 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  47.21 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2974  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0680  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0673  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0697  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0744  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2993  ABC transporter related  46.03 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  45.23 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  43.98 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  44.4 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  44.4 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  46.25 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  46.44 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2453  ABC transporter related  45.08 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  45.34 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0597  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  47.48 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  44.81 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  43.15 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  45.08 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  44.77 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  45.19 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  43.75 
 
 		 265 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  44.81 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  46.18 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  43.57 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  42.92 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  47.9 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  44.12 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  45.87 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  45.61 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  46.03 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  43.51 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  43.57 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  43.98 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  44.71 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  45.64 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  47.66 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  46.86 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  43.85 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  43.51 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>