More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3555 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  100 
 
 
247 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  78.14 
 
 
247 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6886  ABC transporter related  69.8 
 
 
254 aa  338  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3100  ABC transporter related protein  68.57 
 
 
251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  61.13 
 
 
247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4573  ABC transporter related  65.98 
 
 
245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.958024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  61.54 
 
 
247 aa  308  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  60.32 
 
 
247 aa  308  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2777  ABC transporter related  61.57 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867003  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.85 
 
 
246 aa  287  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.17 
 
 
243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.37 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  53.33 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  52.92 
 
 
243 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.58 
 
 
246 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  51.67 
 
 
246 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  56.33 
 
 
249 aa  274  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.51 
 
 
273 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.72 
 
 
267 aa  272  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0877  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.12 
 
 
261 aa  271  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00896077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
240 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  54.66 
 
 
240 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.49 
 
 
249 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 
257 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.17 
 
 
240 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  56.78 
 
 
256 aa  270  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.58 
 
 
245 aa  270  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  52.08 
 
 
240 aa  270  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  54.4 
 
 
259 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 
251 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  51.67 
 
 
246 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 
240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  54.73 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  52.5 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.74 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1234  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.92 
 
 
240 aa  269  4e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.26 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  52.5 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  58.04 
 
 
243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  53.53 
 
 
242 aa  268  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  55.46 
 
 
242 aa  268  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  51.25 
 
 
240 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  52.28 
 
 
260 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.75 
 
 
243 aa  267  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.08 
 
 
252 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  53.53 
 
 
260 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  56.22 
 
 
269 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
253 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  55.6 
 
 
245 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  58.26 
 
 
255 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  55.65 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.67 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
245 aa  265  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.75 
 
 
243 aa  265  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  55.04 
 
 
242 aa  265  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.04 
 
 
246 aa  265  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  51.67 
 
 
240 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
267 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  52.08 
 
 
247 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  55 
 
 
257 aa  264  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  264  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  264  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  264  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  264  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  51.25 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.5 
 
 
239 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
244 aa  263  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
240 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
240 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.1 
 
 
256 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.7 
 
 
244 aa  264  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.77 
 
 
242 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  52.08 
 
 
241 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  53.33 
 
 
247 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  56.73 
 
 
266 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
256 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.5 
 
 
241 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  55.51 
 
 
241 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  54.2 
 
 
262 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  56.67 
 
 
243 aa  261  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  52.5 
 
 
255 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  54.22 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  52.7 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  50 
 
 
240 aa  260  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  52.8 
 
 
259 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 
240 aa  260  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.7 
 
 
249 aa  260  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  51.49 
 
 
242 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  52.5 
 
 
240 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  53.82 
 
 
263 aa  259  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 
240 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  47.92 
 
 
240 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  52.24 
 
 
266 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  54.98 
 
 
256 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  52.92 
 
 
243 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  53.53 
 
 
243 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>