More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3794 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3794  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0167031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2651  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 
243 aa  289  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  48 
 
 
268 aa  229  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  47.84 
 
 
274 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  45.61 
 
 
243 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
270 aa  226  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
242 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  47.28 
 
 
243 aa  224  8e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  47.26 
 
 
247 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  46.44 
 
 
256 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.64 
 
 
246 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  46.86 
 
 
243 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  47.7 
 
 
243 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  48.54 
 
 
242 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  47.28 
 
 
240 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  48.12 
 
 
242 aa  222  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.83 
 
 
244 aa  221  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  45.19 
 
 
242 aa  221  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  45.19 
 
 
242 aa  221  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  45.8 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  47.66 
 
 
240 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  46.44 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  45.61 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  45.49 
 
 
253 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  44.77 
 
 
243 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  45 
 
 
247 aa  219  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  47.5 
 
 
247 aa  218  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  46.03 
 
 
255 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
261 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  45.64 
 
 
247 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 
240 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  45.61 
 
 
239 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  45.19 
 
 
255 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  45.8 
 
 
243 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
251 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
240 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
262 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
245 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
256 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.93 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  43.88 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  43.93 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  45.19 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  45.19 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  43.51 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  45.49 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  45.8 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  46.44 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  45.61 
 
 
254 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
244 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  45.61 
 
 
254 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
252 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  45.61 
 
 
242 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  46.64 
 
 
255 aa  214  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  214  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  43.1 
 
 
249 aa  214  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.18 
 
 
592 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  46.22 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.23 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
594 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  45.19 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  45.6 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  44.77 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  46.47 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  44.77 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  44.4 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  43.93 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  43.44 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  46.22 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
594 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  46.06 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  48 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  46.22 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  44.4 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  46 
 
 
619 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  44.07 
 
 
261 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  47.48 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000378719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  46.4 
 
 
274 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  43.72 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  45.19 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  43.93 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>