More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1418 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1418  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.13 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  39.33 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.53 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.2 
 
 		 327 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.48 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.88 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.22 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.54 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.77 
 
 		 339 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  42.79 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.39 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.03 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.98 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.14 
 
 		 325 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.07 
 
 		 316 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.74 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 345 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.77 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.09 
 
 		 328 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.39 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.87 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.63 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.26 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  35.53 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.89 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.32 
 
 		 317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.12 
 
 		 337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.61 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  32.06 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  32.06 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.77 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.37 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.84 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  38.03 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  40.95 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  35.27 
 
 		 338 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3262  ABC transporter related  39.38 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  36.07 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.41 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 328 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  39.73 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.27 
 
 		 338 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.22 
 
 		 512 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  34.29 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3848  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  34.78 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.57 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.23 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  33.44 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  34.94 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.68 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  37.1 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 		 321 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  33.77 
 
 		 322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.79 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  32.46 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  37.72 
 
 		 319 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  32.57 
 
 		 335 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.8 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  38.68 
 
 		 909 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  34.47 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.49 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.4 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  30.92 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  37.56 
 
 		 339 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  30.92 
 
 		 326 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  31.92 
 
 		 320 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  31.25 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  38.12 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.67 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  36.82 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.15 
 
 		 411 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  32.67 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  36.82 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  34.59 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  31.37 
 
 		 373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  32.01 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2062  ABC transporter related  40.65 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.698735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 307 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  33.22 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>