More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0048 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0048  ABC transporter related  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0966  ABC transporter related  76.41 
 
 
202 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0643  ABC transporter related  55.67 
 
 
197 aa  191  7e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  38.59 
 
 
308 aa  105  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 
309 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  39.69 
 
 
309 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  34.65 
 
 
232 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  39.18 
 
 
309 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  35.38 
 
 
337 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  34.39 
 
 
294 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  30.19 
 
 
305 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  35.33 
 
 
257 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  37.57 
 
 
309 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.94 
 
 
363 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  35.07 
 
 
599 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  33.64 
 
 
280 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  34.91 
 
 
300 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1078  ABC transporter related  33.33 
 
 
286 aa  99  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.85 
 
 
323 aa  98.6  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1559  ABC transporter related  32.8 
 
 
284 aa  98.6  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  33.17 
 
 
310 aa  98.2  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  32.67 
 
 
234 aa  98.2  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  32.98 
 
 
315 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
264 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  30.73 
 
 
297 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  30.23 
 
 
338 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  29.21 
 
 
345 aa  97.1  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  32.98 
 
 
315 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0122  ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  35.08 
 
 
324 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0367  ABC transporter related  31.22 
 
 
309 aa  96.7  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  35.38 
 
 
316 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  37.64 
 
 
251 aa  95.9  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  30.23 
 
 
338 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.55 
 
 
370 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  33.16 
 
 
251 aa  95.5  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.18 
 
 
310 aa  95.5  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  35.58 
 
 
350 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0219  ABC transporter related  32.98 
 
 
317 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.106594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  36.76 
 
 
295 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 
251 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  34.62 
 
 
608 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  33.67 
 
 
311 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  33.88 
 
 
688 aa  95.5  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  30.33 
 
 
247 aa  95.5  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0548  modulator of drug activity  31.25 
 
 
214 aa  94.7  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00351407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  35.08 
 
 
308 aa  94.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  31.96 
 
 
279 aa  94.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  35.87 
 
 
303 aa  94.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  32.47 
 
 
305 aa  94.7  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  35.08 
 
 
308 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  35.08 
 
 
308 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.38 
 
 
308 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  35.08 
 
 
308 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  32.06 
 
 
240 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0214  ABC transporter related  34.85 
 
 
234 aa  94  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  34.25 
 
 
244 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.8 
 
 
308 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  34.02 
 
 
298 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0431  ABC transporter related  33.15 
 
 
278 aa  94  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.739427  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0010  ABC transporter-related protein  32.56 
 
 
345 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  30.91 
 
 
237 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  31.94 
 
 
337 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  30.95 
 
 
362 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  34.47 
 
 
317 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  33.5 
 
 
250 aa  93.2  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
308 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  35.08 
 
 
308 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 
352 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  34.92 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.32 
 
 
250 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
336 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  34.95 
 
 
350 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  31.75 
 
 
371 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  35.71 
 
 
357 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  32.24 
 
 
365 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 
359 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5705  ABC transporter related  32.56 
 
 
366 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
308 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
308 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 
336 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.52 
 
 
281 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  37.22 
 
 
334 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  28.97 
 
 
255 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  29.15 
 
 
264 aa  92.8  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1099  ABC transporter related  36.56 
 
 
274 aa  92.8  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  hitchhiker  0.000176016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  35.16 
 
 
320 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  34.57 
 
 
305 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  33.66 
 
 
248 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  36.41 
 
 
374 aa  92.8  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7197  ABC transporter related  30.32 
 
 
584 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  33.65 
 
 
375 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  32.86 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
296 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  30.16 
 
 
305 aa  92.8  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1238  ABC transporter related  33.71 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  34.74 
 
 
310 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  34.44 
 
 
252 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  31.77 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  31.48 
 
 
371 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>