More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1180 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  100 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.584734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  52.87 
 
 		 314 aa  332  6e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  47.08 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1979  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  56.41 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1286  ABC transporter related  44.9 
 
 		 324 aa  258  6e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  50.19 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  54.66 
 
 		 363 aa  257  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  47.74 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  46.5 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  44.83 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  44.55 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.74 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  54 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.23 
 
 		 370 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  43.45 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  43.82 
 
 		 369 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6262  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.01 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.543134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  42.73 
 
 		 353 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  50.21 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.06 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  45.3 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  45.33 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.11 
 
 		 349 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.81 
 
 		 369 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.76 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  52.36 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  41.92 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  43.47 
 
 		 349 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  49.8 
 
 		 355 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  51.05 
 
 		 369 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  39.94 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  43.17 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  44.14 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  47.74 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  43 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.79 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.74 
 
 		 366 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 367 aa  238  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  42.76 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  43.89 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  41.4 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  40.17 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.4 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  43.12 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  43.77 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.72 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  42.76 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  45.22 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.69 
 
 		 397 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  47.2 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  43.6 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  42.07 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  48.81 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  43.58 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2597  ABC transporter related  42.12 
 
 		 373 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  40.58 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  41.56 
 
 		 351 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  41.3 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  52.14 
 
 		 405 aa  235  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  50 
 
 		 356 aa  235  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  42.91 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2558  ABC transporter related  42.12 
 
 		 371 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2603  ABC transporter related  42.12 
 
 		 371 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  42.61 
 
 		 381 aa  234  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  42.35 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  43.58 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  45.88 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.61 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  48.87 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  44.64 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  40.77 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  49.8 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2554  ABC transporter related  51.75 
 
 		 369 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 376 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  52.65 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.83 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  42.61 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  43.08 
 
 		 352 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 365 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2302  ABC transporter related  41.57 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996895  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.79 
 
 		 367 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.79 
 
 		 367 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  39.12 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  50.64 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  48.22 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>