More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0526 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  100 
 
 
314 aa  628  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  52.87 
 
 
312 aa  332  6e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  43.33 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  42.82 
 
 
365 aa  269  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  47.48 
 
 
355 aa  266  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  47.48 
 
 
355 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  42.04 
 
 
344 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  43.27 
 
 
342 aa  262  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  44.6 
 
 
333 aa  261  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  41.43 
 
 
331 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.36 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  45.64 
 
 
333 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  41.37 
 
 
336 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  45.17 
 
 
330 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  41.69 
 
 
335 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  41.69 
 
 
335 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 
350 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 
333 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  41.46 
 
 
356 aa  256  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1979  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
324 aa  256  4e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  43.19 
 
 
342 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  48.43 
 
 
359 aa  255  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  45.8 
 
 
334 aa  255  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  38.37 
 
 
368 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  48.76 
 
 
364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 
333 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1286  ABC transporter related  43.12 
 
 
324 aa  253  3e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  38.59 
 
 
349 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  40 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  39.7 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  43.9 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  41.51 
 
 
358 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  42.86 
 
 
333 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  44.76 
 
 
332 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  43.9 
 
 
333 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  38.35 
 
 
366 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  41.2 
 
 
349 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  41.89 
 
 
340 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.9 
 
 
352 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 
333 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  43.94 
 
 
333 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  40 
 
 
350 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 
333 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  43.21 
 
 
332 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  44.41 
 
 
338 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  40.78 
 
 
348 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  48.76 
 
 
370 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  42.41 
 
 
361 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  47.3 
 
 
376 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  43.4 
 
 
332 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  42.26 
 
 
332 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  38.46 
 
 
353 aa  248  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  44.25 
 
 
332 aa  248  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
378 aa  248  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47.86 
 
 
366 aa  248  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0010  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 
345 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  41.77 
 
 
356 aa  248  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
333 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
351 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  36.47 
 
 
375 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  48.75 
 
 
349 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
333 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  41.98 
 
 
353 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  43.66 
 
 
356 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
335 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
348 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  38.22 
 
 
374 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
366 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
333 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  43.45 
 
 
325 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  40.47 
 
 
348 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  42.86 
 
 
336 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.45 
 
 
372 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2542  putative maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  40 
 
 
366 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  40.35 
 
 
353 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  40.47 
 
 
348 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  47.28 
 
 
382 aa  246  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  38.87 
 
 
352 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  44.8 
 
 
359 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  40.56 
 
 
350 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  38.39 
 
 
348 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  40.58 
 
 
368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  42.66 
 
 
341 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  37.86 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  40.47 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  43.55 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  39.88 
 
 
361 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  41.48 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  40.49 
 
 
346 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  45.53 
 
 
366 aa  245  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  40.64 
 
 
333 aa  245  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  43.48 
 
 
359 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  41.81 
 
 
335 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 
368 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  43.05 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  44.57 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  40.74 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>