More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2112 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  97.06 
 
 
340 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  98.8 
 
 
334 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
334 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0997  ABC transporter, ATP-binding protein  98.36 
 
 
305 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108558  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  88.62 
 
 
328 aa  567  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.44 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.02 
 
 
330 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.71 
 
 
326 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  34.09 
 
 
330 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.2 
 
 
324 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
322 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 
324 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.31 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.79 
 
 
324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.83 
 
 
312 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.37 
 
 
321 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.11 
 
 
328 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 
321 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
327 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
316 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  41.38 
 
 
297 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
351 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 
334 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.94 
 
 
326 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
327 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  34.16 
 
 
310 aa  159  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.91 
 
 
323 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.15 
 
 
329 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6251  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.53 
 
 
353 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382006  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.86 
 
 
333 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
313 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  35.32 
 
 
260 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
255 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.16 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.02 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.59 
 
 
320 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
323 aa  156  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 
321 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  43.27 
 
 
247 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 
318 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  37.91 
 
 
304 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.69 
 
 
323 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  41.98 
 
 
242 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  33.66 
 
 
339 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  33 
 
 
320 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.11 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.24 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34 
 
 
338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.34 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3254  hypothetical protein  42.99 
 
 
331 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0305467  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  37.59 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.2 
 
 
330 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  37.59 
 
 
304 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  31.62 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.45 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.69 
 
 
331 aa  152  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  37.66 
 
 
307 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.17 
 
 
338 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  37.97 
 
 
373 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 
322 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.16 
 
 
325 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.43 
 
 
327 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.15 
 
 
331 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 
318 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 
368 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.34 
 
 
328 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
335 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 
308 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
266 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  39.6 
 
 
665 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.05 
 
 
282 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.02 
 
 
316 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
309 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2364  ABC transporter related  39.74 
 
 
327 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021349  normal  0.0168897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.9 
 
 
343 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  32.12 
 
 
330 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.94 
 
 
326 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  41.26 
 
 
239 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  37.14 
 
 
351 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  37.14 
 
 
351 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  38.94 
 
 
279 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 
325 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  41.63 
 
 
265 aa  149  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  35.78 
 
 
250 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.22 
 
 
304 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24930  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
325 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  34.38 
 
 
338 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  34.62 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0617  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.09 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899529  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.86 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  43.5 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  38.7 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  38.19 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.19 
 
 
350 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>