More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0026 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  100 
 
 
265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  62.55 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  63.14 
 
 
253 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  64.75 
 
 
249 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  62.06 
 
 
249 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  61.75 
 
 
249 aa  278  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  62.7 
 
 
249 aa  278  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  61.61 
 
 
239 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  57.66 
 
 
242 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  52.45 
 
 
256 aa  245  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  61.82 
 
 
264 aa  244  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  55.66 
 
 
239 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  57.76 
 
 
242 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  54.98 
 
 
269 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  57.76 
 
 
242 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  58.56 
 
 
242 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  57.08 
 
 
272 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  48.64 
 
 
239 aa  215  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  53.5 
 
 
246 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  53.09 
 
 
246 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  53.09 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  45.04 
 
 
285 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  50.88 
 
 
250 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  48.02 
 
 
255 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  49.07 
 
 
317 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  48.57 
 
 
247 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  45.31 
 
 
237 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
323 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
249 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.82 
 
 
324 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
323 aa  168  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.13 
 
 
326 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  42.41 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.55 
 
 
324 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.46 
 
 
339 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  39.35 
 
 
321 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
325 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 
330 aa  161  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 
266 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 
323 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
321 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
323 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.27 
 
 
312 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 
321 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.57 
 
 
327 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 
348 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 
327 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 
324 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.36 
 
 
312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  40.65 
 
 
321 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
330 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 
338 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  41.86 
 
 
315 aa  155  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 
325 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  41.49 
 
 
339 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2498  ABC transporter component  44.5 
 
 
327 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.497129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  37.18 
 
 
300 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
340 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
312 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.67 
 
 
295 aa  152  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.97 
 
 
328 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  38.03 
 
 
309 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
334 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
312 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
312 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
343 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  40.18 
 
 
330 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
312 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
312 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
312 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
312 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
312 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
334 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  35.91 
 
 
312 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.96 
 
 
305 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  39.37 
 
 
337 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
325 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 
310 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  34.73 
 
 
260 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
328 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
328 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  36.28 
 
 
320 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 
308 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 
308 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.64 
 
 
311 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 
279 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  39.47 
 
 
593 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 
313 aa  148  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 
316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>