More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2667 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  65.4 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  56.9 
 
 		 272 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  52.97 
 
 		 249 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  54.36 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  53.81 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  51.69 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  52.54 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  50.64 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  54.36 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  53.39 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  54.36 
 
 		 246 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  52.12 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  51.69 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  51.05 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  52.1 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  55.66 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  51.87 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  48.95 
 
 		 256 aa  214  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  47.23 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  45.96 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  50.42 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  50.63 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  48.62 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  54.13 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  49.58 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 		 323 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 		 324 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.27 
 
 		 323 aa  168  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.91 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 		 321 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.67 
 
 		 324 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  41.97 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 327 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 		 338 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  37.39 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 334 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 		 325 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 		 339 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 323 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  37.16 
 
 		 321 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.98 
 
 		 312 aa  152  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  34.73 
 
 		 589 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 		 328 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 328 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  34.53 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.75 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  34.53 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 339 aa  151  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  34.08 
 
 		 312 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.49 
 
 		 328 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1742  ABC transporter related  36.48 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000920436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 		 325 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 334 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  36.07 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 340 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.92 
 
 		 344 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 334 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.43 
 
 		 334 aa  148  9e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.36 
 
 		 312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 		 329 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  39.72 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0949  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  38.79 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  40.18 
 
 		 599 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 1171 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 333 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  34.04 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  36.15 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.83 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>