More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1552 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  97.68 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  95.7 
 
 		 302 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  95.03 
 
 		 302 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  76.97 
 
 		 303 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  76.38 
 
 		 308 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  76.32 
 
 		 303 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  76.64 
 
 		 303 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  75.99 
 
 		 303 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  67.88 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  65.23 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  62.91 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  60.93 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  61.59 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2284  ABC transporter related  61.59 
 
 		 298 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  54.79 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.42 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  41.55 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  40 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.32 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  38.4 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  29.71 
 
 		 369 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  34.58 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  32.82 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.36 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0617  ABC transporter related  35.61 
 
 		 243 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.854528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  37.62 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.5 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  35.42 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  38.89 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.94 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  29.35 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  36.84 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  32.64 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.17 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  31.21 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  36.4 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.34 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  32.96 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  36.84 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  39.61 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  30.45 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  31.32 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.37 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  33.33 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.98 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.44 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  35.19 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  34.95 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  31.7 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.49 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  33.91 
 
 		 332 aa  145  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  29.01 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  36.32 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.52 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.57 
 
 		 344 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  39.23 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.08 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.24 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  36.36 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  33.33 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  32.46 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  32.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  35.04 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  32.17 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.6 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.84 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  31.34 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  32.57 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  31.34 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  37.32 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.97 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  35.62 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.98 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  37.2 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.57 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  35.92 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  34.93 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.79 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.55 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>