More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5188 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  95.1 
 
 
367 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0349  ABC transporter, ATPase subunit  97.55 
 
 
367 aa  716    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448761  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4969  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  98.09 
 
 
367 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149791  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  100 
 
 
367 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583464  normal  0.706165 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3068  ABC transporter related  97.55 
 
 
367 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4660  ABC transporter related  99.18 
 
 
367 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960037  normal  0.0689846 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5299  ABC transporter related  97.55 
 
 
367 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629612  hitchhiker  0.0055126 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.6 
 
 
365 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  85.6 
 
 
365 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2213  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.6 
 
 
365 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527977  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0897  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.6 
 
 
365 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1759  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.6 
 
 
365 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354405  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0856  ABC transporter, ATP-binding protein  86.65 
 
 
337 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0425057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1901  ABC transporter, ATP-binding protein  86.65 
 
 
337 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  86.35 
 
 
337 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1874  ABC transporter, ATPase subunit  76.86 
 
 
366 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4790  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  76.86 
 
 
366 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165065  hitchhiker  0.0000108781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5066  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  74.93 
 
 
367 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478807  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.72 
 
 
372 aa  275  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.42 
 
 
376 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.65 
 
 
366 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.44 
 
 
353 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  41.49 
 
 
323 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
351 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
353 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
353 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.44 
 
 
352 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  40 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 
366 aa  252  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
333 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.46 
 
 
360 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.23 
 
 
362 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.27 
 
 
371 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.13 
 
 
380 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  43.35 
 
 
353 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
333 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
333 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  42.51 
 
 
333 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  41.71 
 
 
369 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  41.71 
 
 
369 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  41.71 
 
 
369 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  41.71 
 
 
369 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 
333 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 
353 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  41.44 
 
 
369 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.43 
 
 
372 aa  248  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.25 
 
 
371 aa  249  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 
355 aa  249  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.98 
 
 
408 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.71 
 
 
372 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.15 
 
 
364 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.15 
 
 
364 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  43.47 
 
 
360 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  36.86 
 
 
367 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 
357 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.35 
 
 
373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  45.72 
 
 
339 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  47.79 
 
 
353 aa  245  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  41.21 
 
 
542 aa  245  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.23 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  51.67 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.73 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  39.04 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.62 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.47 
 
 
385 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  50.82 
 
 
367 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 
359 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.82 
 
 
367 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.23 
 
 
358 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.74 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.25 
 
 
384 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
352 aa  242  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.43 
 
 
377 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.8 
 
 
426 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.39 
 
 
352 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 
359 aa  242  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  41.09 
 
 
337 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  51.03 
 
 
368 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  45.49 
 
 
371 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.21 
 
 
363 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  39.95 
 
 
372 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.96 
 
 
370 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  51.03 
 
 
399 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  43.1 
 
 
366 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.52 
 
 
370 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.96 
 
 
372 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.96 
 
 
368 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  42.05 
 
 
360 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.27 
 
 
328 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  42.05 
 
 
360 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.77 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.14 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.77 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.77 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>