More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4790 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5066  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  88.01 
 
 
367 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478807  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4790  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  100 
 
 
366 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165065  hitchhiker  0.0000108781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1874  ABC transporter, ATPase subunit  95.9 
 
 
366 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  77.6 
 
 
365 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1759  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  77.6 
 
 
365 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354405  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  77.6 
 
 
365 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0897  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  77.6 
 
 
365 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2213  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  77.6 
 
 
365 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  76.86 
 
 
367 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583464  normal  0.706165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  81.31 
 
 
337 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3068  ABC transporter related  76.58 
 
 
367 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4660  ABC transporter related  76.58 
 
 
367 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960037  normal  0.0689846 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5299  ABC transporter related  76.58 
 
 
367 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629612  hitchhiker  0.0055126 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0856  ABC transporter, ATP-binding protein  80.42 
 
 
337 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0425057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1901  ABC transporter, ATP-binding protein  80.42 
 
 
337 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0349  ABC transporter, ATPase subunit  75.76 
 
 
367 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448761  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4969  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  76.31 
 
 
367 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149791  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  76.52 
 
 
367 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.12 
 
 
372 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  44.26 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 
376 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 
333 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.3 
 
 
371 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.79 
 
 
364 aa  262  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.48 
 
 
364 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  40.3 
 
 
323 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.34 
 
 
371 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  51.82 
 
 
353 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  53.75 
 
 
353 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.35 
 
 
408 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.88 
 
 
372 aa  256  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.97 
 
 
373 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
349 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.08 
 
 
366 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.79 
 
 
372 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.51 
 
 
372 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.51 
 
 
360 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.95 
 
 
354 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
353 aa  255  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 
353 aa  255  8e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  40.35 
 
 
339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  38.81 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.87 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  39.63 
 
 
329 aa  253  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.58 
 
 
352 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.9 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  42.9 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.9 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.9 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.9 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.9 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.77 
 
 
359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.89 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.89 
 
 
378 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.89 
 
 
378 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.89 
 
 
378 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 
353 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.83 
 
 
353 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 
366 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.34 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.61 
 
 
378 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.61 
 
 
378 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.61 
 
 
378 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 
380 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.72 
 
 
353 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 
333 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.89 
 
 
378 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.38 
 
 
368 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.25 
 
 
386 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  39.3 
 
 
369 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  42.45 
 
 
360 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  45.19 
 
 
357 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
394 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  42.66 
 
 
333 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  39.02 
 
 
369 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
333 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  41.19 
 
 
372 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  39.02 
 
 
369 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  39.95 
 
 
369 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  50.6 
 
 
368 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  39.02 
 
 
369 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  42.9 
 
 
347 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  43 
 
 
333 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  40 
 
 
363 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  49.21 
 
 
388 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  42.45 
 
 
360 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  42.45 
 
 
360 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 
359 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  41.67 
 
 
353 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
367 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.14 
 
 
363 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.26 
 
 
355 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 
356 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.77 
 
 
426 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  41.4 
 
 
366 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  42.82 
 
 
366 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  44.16 
 
 
350 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.73 
 
 
343 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.08 
 
 
344 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>