More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0212 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0212  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0892  ABC transporter related  47.84 
 
 
232 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.494733  normal  0.0891232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  46.26 
 
 
218 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0651  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 
263 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 
327 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.96 
 
 
348 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.96 
 
 
347 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 
355 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  39.35 
 
 
380 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  39.19 
 
 
357 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
373 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  40 
 
 
343 aa  158  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
355 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  38.89 
 
 
380 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  37.26 
 
 
385 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
628 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  38.53 
 
 
352 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  39.81 
 
 
355 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  39.35 
 
 
355 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  38.29 
 
 
347 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  39.22 
 
 
359 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.71 
 
 
378 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
343 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  39.35 
 
 
355 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  39.37 
 
 
349 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  39.35 
 
 
355 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.2 
 
 
379 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  39.35 
 
 
355 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  39.35 
 
 
355 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  36.65 
 
 
368 aa  154  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
354 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 
350 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 
370 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  39.46 
 
 
348 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  39.91 
 
 
348 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
357 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.46 
 
 
356 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  40.28 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  37.18 
 
 
369 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  41.26 
 
 
349 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4182  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.03 
 
 
239 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.564485 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.43 
 
 
343 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3858  sulfate/molybdate ABC transporter ATPase  41.63 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  39.35 
 
 
355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 
374 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
233 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
233 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
233 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
233 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  40.28 
 
 
213 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
233 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
233 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
336 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
233 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  37.96 
 
 
380 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
348 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
348 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  40 
 
 
233 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
349 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  39.27 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  40.37 
 
 
336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  42.38 
 
 
602 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
375 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  37.21 
 
 
353 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
375 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.99 
 
 
357 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.29 
 
 
355 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
369 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4341  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  39.52 
 
 
345 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
365 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 
375 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  41.43 
 
 
352 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
365 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 
356 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.91 
 
 
357 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.27 
 
 
363 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  35.96 
 
 
338 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.35 
 
 
355 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0791  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
239 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
367 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  39.32 
 
 
351 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
348 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.05 
 
 
338 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  39.01 
 
 
372 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  39.01 
 
 
372 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  37.56 
 
 
344 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  33.63 
 
 
309 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  36.77 
 
 
244 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  38.65 
 
 
343 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  37.9 
 
 
338 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.27 
 
 
363 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.27 
 
 
363 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 
343 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>